管理業務（管理課）
- 当部全体の業務調整
- 職員の服務、給与、福利厚生業務
- 国有財産、物品の管理業務
- 広報業務
- 地域連携業務（イベント開催、地域行事への参加など）
- 学生募集活動
職場体験学習
海開き式典参加
地域イベントでの展示訓練
警備救難業務（警備救難課）
- 海上犯罪（無資格・無検査運航、密漁、廃棄物の不法投棄など）の取締り
- 密輸密航の水際阻止（外国船舶への立入検査など）
- テロの未然防止（関係機関との合同訓練など）
- 海難救助（即応体制の確保、民間救助組織との連携など）
- 海洋汚染の監視取締り
- 海洋環境保全のための啓発活動（講習会など）
- 自然災害、油等流出災害への対応（官民合同訓練など）
港湾テロ対策訓練
ヘリによる吊上げ救助
海上防災訓練
交通業務（交通課）
- 海難防止啓発活動（訪船指導、講習会など）
- 航路標識の保守・管理
- 港長事務（港則法に基づく各種許可・届出受付など）
- 海の安全情報の提供
- 那覇水路の航行管制
工事･作業許可の窓口業務
官民合同の安全啓発ﾊﾟﾄﾛｰﾙ
灯標の点検作業
自治体連携協力によるデジタルサイネージを利用した啓発
民間企業協力による安全啓発リーフレットの配布
